Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim30aP15533 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim30aP15533 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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