Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms