Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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