Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa7P02830 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms