Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dgcr6O35347 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms