Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcm2O09102 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcm2O09102 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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