Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm379J3QQ19 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm379J3QQ19 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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