Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms