Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms