Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms