Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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