Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms