Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29094F6Q785 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29094F6Q785 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms