Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Irf2bp2E9Q1P8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms