Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3002E9PW72 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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