Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf217D3YYI7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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