Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms