Protein–RNA interactions for Protein: A3KFM7

Chd6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd6A3KFM7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd6A3KFM7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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