Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc38A2VDH3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc38A2VDH3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc38A2VDH3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc38A2VDH3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc38A2VDH3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc38A2VDH3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc38A2VDH3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms