Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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