Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms