Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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