Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vav3Q9R0C8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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