Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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