Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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