Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Kcnip3Q9QXT8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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