Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms