Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms