Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms