Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms