Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dkc1Q9ESX5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dkc1Q9ESX5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms