Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms