Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl40Q9D783 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms