Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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