Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sdr42e1Q9D665 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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