Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms