Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms