Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tm4sf20Q9CQY8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms