Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms