Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms