Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms