Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Chmp3Q9CQ10 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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