Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms