Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo2Q99LG2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo2Q99LG2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms