Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ciao1Q99KN2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ciao1Q99KN2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms