Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmed9Q99KF1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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