Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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