Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms