Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpusd1Q8VCZ8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms