Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc28Q8VCE1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms